超声波用于中药的提取可以显著降低溶剂消耗，缩短萃取时间，在较低温度可以达到更高的提取率，而且不会破坏活性成分的中药，可广泛用于传中医统皂苷、生物碱、黄酮类、蒽醌类、有机酸、多糖等成分的提取。超声波诱导超声空化，活化反应液体在容器在倒塌的空化气泡伴随着冲击波或射流作用于细胞壁和让它破碎。超临界CO2萃取的绿色无污染，少溶剂残留或无活性成分，产品不容易失活、高产品质量，成为近年来研究的热点。但同时这种技术存在萃取压力、长时间、高萃取率低，能耗高的大剂量的夹带剂和缺点，大大限制了其工业应用。如果超声波应用于超临界流体萃取可明显减少。

　　超声波在生物技术的应用是个新的突破。研究表明，超声波作用可激活某些酶与细胞参与的生理生化过程，通过改变反应物的质量传输机制，提高酶的活性、加速细胞新陈代谢过程。超声波用于淀粉的降解，可显著增加淀粉在水中的溶解度而保留明显的淀粉特征，但超声波多次处理后酶活性有所降低；超声波用于降解壳多糖速度快、成本低、氨基酸含量不变；超声波用于提取真菌多糖，如虫草多糖、香菇多糖、猴头多糖等，超声波酶法与传统工艺比较提取率高、反应过程无物料损失和副反应；此外超声波还用于降解提取多种葡聚糖等。

　　此外，超声波用于改善过滤过程主要表现在可使超细粒子凝聚，因此过滤加快;系统提供足够的振动能量，保持粒子悬浮的一部分，提供了一个更自由通行的溶剂分离;加强传播的液体通过多孔介质。超声波已成功用于工业混合的真空过滤机，如煤泥过滤。滤浆是困难和耗时的工作，当超声波用于过滤、质量分数的煤泥水迅速从减少到25、50和普通方法只能减少到40。超声波应用于蛋白质超滤可有效提高分离效率，减少蛋白质吸附在膜。超声波方法具有效率高、准确、可靠、操作简便等特点，超声的电渗析分离也可以扮演一个角色。研究超声辐照能提高电解液的能力通过膜，以提高效率的电渗析。